Modern and Contemporary Chinese Political Thought;
Intellectual and Cultural History of Modern China;
Sino-Japanese Relations.

• 《中國人留學日本史》（實藤惠秀原著，譚汝謙、林啟彥合譯）。香港：中文大學出版社，1982年；北京：三聯書店，1983；北京大學出版社，2012。

• 《三十三年之夢》（宮崎滔天著，林啟彥譯注）。香港：三聯書店，1981；桂林：廣西師範大學出版社，2011。

• 《近代中國啟蒙思想研究》。南昌：百花洲文藝出版社，2008。

• 《教研論學集》。台北：文史哲出版社，2007。

• 與李金強、鮑紹霖合編：《有志竟成──孫中山、辛亥革命與近代中國》上、下冊。香港：香港中國近代史學會，2005。

• 與朱益宜合編：《鴉片戰爭的再認識》。香港：中文大學出版社，2003。

• 與黃文江合編：《王韜與近代世界》。香港：香港教育圖書公司，2000 。

• 與劉桂生、王憲明合編：《嚴復思想新論》。北京：清華大學出版社，1999 。

• 《步向民主》。香港：中華書局，1989。

• 另有著譯專書多種及學術論文五十餘篇。